----O Centro Universitário Assunção é administrado e coordenado pela Reitoria, assessorada pelo Conselho Superior, sendo organizado em departamentos que representam a Estrutura Universitária.A reitoria tem como principais responsabilidades dirigir, administrar e exercer o controle das Faculdades, promovendo e coordenando a integração e a execução das suas atividades, zelando pela observância da legislação educacional vigente.As faculdades que constituem o UNIFAI congregam os cursos respectivos à sua área, considerando o aspecto didático, científico e administrativo. São quatro faculdades a saber:

Faculdade de Administração e Ciências Contábeis;
Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras;

Faculdade de Informática e Computação;

Faculdade de Direito.

---- Cada Faculdade é composta pelos seguintes órgãos: diretoria, congregação, conselho departamental e departamentos. Cada um destes órgãos é de importância vital para o funcionamento da instituição e da vida acadêmica.